BioBlender - это программный пакет, основанный на программном обеспечении
3D-моделирования с открытым исходным кодом. Блендер

Биология работает в наномасштабе, с объектами, невидимыми для человеческого
глаза. С помощью BioBlender можно показать некоторых персонажей, которые
населяют наши клетки, основываясь на научных данных и высочайшем стандарте
трехмерных манипуляций. Ученые всего мира изучают белки на атомном уровне и
размещают информацию в общедоступном хранилище Protein Data Bank, где каждая
молекула описывается как список ее атомов и их трехмерные координаты.

С помощью BioBlender пользователи могут обрабатывать белки в трехмерном
пространстве, фотореалистично отображать свою поверхность и разрабатывать
движения белков на основе известных конформаций.

Файлы PDB могут быть загружены из пользовательского каталога или загружены
непосредственно с сайта PDB (путем вставки кода PDB). Белок отображается в 3D
(в виде атомов или молекулярной поверхности), и пользователь может рассчитать
и визуализировать его поверхностные свойства, молекулярный липофильный
потенциал и электростатический потенциал. Для движения белка BioBlender
вычисляет промежуточные звенья между двумя конформациями, используя Blender
Game Engine. Программа выводит как промежуточные файлы PDB, так и
визуализированные изображения в виде фильма.

BioBlender - это реализация Blender, свободно распространяемой,
мультиплатформенной, совместимой и поддерживаемой программы 3D-анимации,
визуальных эффектов и видеоигр с открытым исходным кодом.

Сочетание трехмерной компьютерной графики, игрового движка и научных программ
делает BioBlender полноценным инструментом для разработки движения белков и
отображения их поверхностных особенностей с помощью визуального кода,
основанного на текстурировании и специальных эффектах частиц. Таким образом,
можно показать физические и химические свойства молекулы в движении.

BioBlender является результатом сотрудничества, проводимого группой SciVis в
CNR в Пизе (Италия), между учеными различных дисциплин (биология, химия,
физика, компьютерные науки) и