Cytoscape icon

Cytoscape

Cytoscape icon

Cytoscape

  8
Бесплатное ПО Открытый код
Категории: Социальные сети и коммуникация
Платформы: Mac Linux Windows
Особенности:
bioinformatics integration интеграция expression visualization social-network



Cytoscape - это программная платформа с открытым исходным кодом для
визуализации сложных сетей и их интеграции с любыми типами данных атрибутов.
Доступно множество плагинов для различных проблемных областей, включая
биоинформатику, анализ социальных сетей и семантическую сеть.

Cytoscape поддерживает множество вариантов использования в молекулярной и
системной биологии, геномике и протеомике:

Загрузка наборов данных молекулярного и генетического взаимодействия во многих
форматах
Проектирование и интеграция глобальных наборов данных и функциональных
аннотаций
Создание мощных визуальных отображений для этих данных
Выполнить расширенный анализ и моделирование с помощью плагинов Cytoscape
Визуализируйте и анализируйте наборы данных о человеческом пути, такие как
Reactome или KEGG.

Аналоги (11):

  • Gephi

    Gephi - это программное обеспечение с открытым исходным кодом для визуализации и анализа графиков больших сетей.
      42
    Бесплатное ПО Открытый код
    Mac Linux Windows
    исследование layout graph-visualization интерактивное исследование графов 3d-rendering graphs visualization filtering
  • Linkurious

    Локальное программное обеспечение для визуализации и анализа графиков для исследования сложных связанных данных.
      7
    Платное ПО
    Web
    аналитика данных graph-database graph-visualization data-visualization identity-fraud обнаружение мошенничества graphs big-data threat-intelligence visualization
  • NodeXL

    NodeXL - это бесплатный шаблон с открытым исходным кодом для Microsoft® Excel® 2007 и 2010, который делает его ...
      6
    Бесплатное ПО Открытый код
    Windows
    excel-надстройка excel-add-in microsoft office excel ontology
  • Polinode

    Polinode - это инструмент, который позволяет легко выполнять мощный сетевой анализ.
      6
    Платное ПО
    Web
    программное обеспечение как сервис change-management совместная работа network analysis enterprise data-analysis visualization business-and-commerce office-suite
  • Wandora

    Wandora - это универсальное приложение для извлечения, управления и публикации информации, основанное на ...
      6
    Бесплатное ПО Открытый код
    Mac Linux Windows
    information-managers ontology information-publishers information-extractors information-extractor information-extract information-management information-publish information-publishing information-extracting information-publisher
  • KeyLines Graph Visualization Toolkit

    KeyLines - это JavaScript-инструментарий для создания высокопроизводительных приложений визуализации графиков ...
      4
    Платное ПО
    Web Linux Windows Mac iOS Android
    layout chart javascript-library graph-visualization data-visualization social-media-analysis diagrams flowchart network-visualization diagramming javascript graphs visualization геопространственный анализ
  • Pathomx

    Pathomx - это инструмент для анализа и визуализации экспериментальных данных.
      1
    Бесплатное ПО Открытый код
    Mac Windows
    proteomics scientific bioinformatics science omics genomics research metabolomics transcriptomics python-app Не поддерживается
  • Neoclipse

    Neoclipse - это отдельное приложение для взаимодействия с Neo4j (каталог базы данных или ...
      1
    Бесплатное ПО Открытый код
    Windows
    layout chart graph-visualization diagrams diagramming graphs visualization
  • Touchgraph Navigator

    TouchGraph - производитель программного обеспечения для визуализации данных TouchGraph Navigator 2.
      1
    Платное ПО
    Linux Windows
    visualization biology
  • Prefuse

    префузионный инструментарий визуализации
      0
    Бесплатное ПО Открытый код
    Mac Linux Windows
    layout graphics toolkit java animation tree interface interaction visualization user
  • Socilyzer

    Веб-инструмент для проведения анализа социальных сетей: от сбора данных до графика ...
      0
    Бесплатное ПО
    Web
    аналитика данных creating-graphs graph-visualization sociogram graphs social-media-analysis