DNAssist предоставляет интуитивно понятный единый интерфейс, в котором файлы
последовательности отображаются, редактируются и анализируются. Пользователь
может настроить отображение в окнах редактора, выбрав шрифт, размер шрифта и
длину строки. Последовательность анализируется простым переносом окна
редактора вверх и выбором требуемого анализа из меню. Все анализы также могут
быть выполнены в выбранной области последовательности в окне редактора. Если
щелкнуть правой кнопкой мыши, появится контекстное контекстное меню. Это дает
пользователю удобный ярлык для большинства пунктов меню. Анализы, доступные на
DNAssist, включают в себя:
Преобразование последовательности ДНК между круговой и линейной формами
Преобразование ДНК в РНК или последовательность белка
Преобразование РНК в ДНК или последовательность белка
Перевод последовательности ДНК в аминокислотную последовательность в одном,
трех или всех шести кадрах
Расположение открытых рамок считывания (ORF) в последовательности ДНК
Расположение определенных шаблонов последовательности в последовательности
(это позволяет использовать подстановочные знаки, несоответствия и пропуски)
Выполнение анализа рестриктаз с определенным набором энзимов
Выполнение анализа промотора ДНК с указанными факторами транскрипции
Локализация сильных сигналов позиционирования нуклеосомы в ДНК
Выполнение множественных выравниваний ДНК, РНК или белков
Получение молекулярной массы нуклеиновой кислоты или белка
Получение температуры плавления олигонуклеотида
Вычисление pI белка
Расчет гидрофильного, гидрофобного или антигенного профиля белка
Получение молярного коэффициента поглощения и E0.1% нуклеиновой кислоты или
белка
Получение нуклеотидного или аминокислотного состава нуклеиновой кислоты или
белка
DNAssist объединяет все эти функции в одно тесно интегрированное приложение
Windows.
Результат анализа отображается в окне результатов и может быть распечатан,
сохранен на диске или скопирован и вставлен в сторонние приложения.
Сохраненные или скопированные результаты сохраняют формат, в котором они были
отображены.